山西中医学院的前身为1978年创办的山西医学院中医大学班。
1982年由国务院批准筹建。
1989年，正式挂牌成立。
1999年，学校通过了原国家教委本科教学工作合格评价。
2001年，学校获得了硕士单位授予权。
2002年，开始招收留学生。
2007年，学校以"良好"的成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。
2013年，获批招收港澳台地区本科生。
2017年2月27日，山西省人民政府学位委员会、山西省教育厅正式批准山西中医学院为新增博士学位授予单位（点）立项建设高校，建设期为3年。
2017年5月，教育部致函省人民政府，批复同意山西中医学院正式更名为山西中医药大学。
2017年6月，学校新增植物保护、康复治疗学、应用心 理学三个学士学位授权专业。6月15日，学校分别与左云县、大同市矿区人民政府签署校地合作协议，学校与左云县、大同市矿区中医院分别签署山西中医药大学附属医院医疗联合体合作协议书 。同月，国家中医药管理局批准以山西中医药大学为建设单位的“多发性硬化益气活血重点研究室”正式立项，建设为国家中医药管理局重点研究室，实现了学校在该项目建设上零的突破 。6月26日，学校实施“1331工程”统筹推进“双一流”建设报告会暨揭牌仪式在大学生活动中心举行 。
2017年7月24日，学校针推学院（第三中医院）、中西医结合临床学院（中西医结合医院）分别召开干部大会，宣布临床学院与直属附属医院实施“院院合一”管理体制及相关任命决定。
院系设置
| 院系设置 |
|---|
| 基础医学院 | 中医临床学院 | 针灸推拿学院 |
| 中药学院 | 护理学院 | 中西医结合临床学院 |
| 医药管理学院 | 傅山学院 | 人文学院 |
| 制药与食品工程学院 | 继续教育学院(推拿职业技术学院) | 研究生部 |
| 思想政治理论教学研究部 | 体育部 | - |
专业设置具体专业
| 专业大类
| 专业小类
|
|---|
| 药物分析(本科) | 医学 | 药学 |
| 生物制药(本科) | 工学 | 生物工程类 |
| 食品科学与工程(本科) | 工学 | 轻工纺织食品类 |
| 制药工程(本科) | 工学 | 化工与制药 |
| 中药学(本科) | 医学 | 药学 |
| 药学(本科) | 医学 | 药学 |
| 护理学(本科) | 医学 | 护理学 |
| 针灸推拿学(本科) | 医学 | 中医医学 |
| 中西医临床医学(本科) | 医学 | 中医医学 |
| 中医学(本科) | 医学 | 中医医学 |
| 康复治疗学(本科) | 医学 | 临床医学和医学技术类 |
| 植物保护(本科) | 农学 | 植物生产类 |
| 生物技术(本科) | 理学 | 生物科学 |
| 应用心理学(本科) | 理学 | 心理学 |
| 市场营销(本科) | 管理 | 工商管理类 |
| 信息管理与信息系统(本科) | 管理 | 管理科学与工程类 |
学校领导
| 职务 | 姓名 |
|---|
党委书记
| 段志光
|
党委副书记、院长
| 李青山 |
党委副书记
| 冯海
|
副院长
| 张永德、冀来喜、王晞星
|
党委委员、纪委书记
| 郭文平 |
