新乡医学院的渊源可追溯到1896年英国人劳海德在古城卫辉开办的西医诊所，1903年，在该诊所基础上建成博济医院;1920年，医院扩建后更名为惠民医院;1922年加拿大人维特立夫创办惠民医院护士学校，招收四年制护理专业学生并由中华护理学会(1923年名为"中华护士会")颁发文凭，成为学校教育教学史的开端。
1947年9月，冀鲁豫行署在山东省阳谷县大布乡李堂村成立卫生学校;1949年，冀鲁豫行署卫生学校和哈利逊医院从山东迁入卫辉，与惠民医院及护士学校合并，并接收解放军第三机动医院部分医护人员和干部，1950年成立平原省医科学校。
1952年11月，平原省撤销，学校由华北行政委员会接管，更名为华北第二医士学校。
1953年5月，国家卫生部决定，将华北第二医士学校迁往河北省通县(现北京市通州区)。
1953年9月，河南省人民政府决定，将郑州第一医士学校、南阳第二医士学校、安阳卫校、濮阳护士学校及华北第二医士学校的附属医院等单位合并，在华北第二医士学校老校址，成立河南省汲县医士学校。
1956年7月，省卫生厅决定，河南省汲县医士学校更名为汲县卫生学校。
1958年3月，河南省汲县卫生学校更名为新乡专区医学院，隶属新乡专区领导;8月，学校升格为高等医学专科学校，开始招收专科生。
1959年9月，新乡专区医学院更名为河南省汲县医学专科学校。
1962年，学校更名为豫北医学专科学校。
1982年11月，学校升格为本科，定名为新乡医学院，同时在新乡市建设新校区。
1991年，学校办学主体由卫辉搬迁到新乡市新校区。
1998年6月，经国务院学位委员会批准，成为硕士学位授予单位。
2013年12月，新乡医学院拟更名为河南医药学院。
2016年，获批为国家“十三五”中西部高校基础能力建设工程（二期）支持高校。
院系专业
截至2018年5月，学校设有21个教学院（系、部），具有研究生、本科、留学生、中外合作办学、成人教育等较为完备的高等教育体系，建有一个独立学院——三全学院。
学校学科涵盖医学、理学、工学、文学、法学、管理学、教育学等7个门类，拥有河南省特色学科（A类）1个、省级重点学科一级学科5个、二级学科11个；拥有基础医学、临床医学、药学、生物学、心理学、生物医学工程等7个一级学科硕士学位授权点，52个二级学科学位点和临床医学、公共卫生、护理、公共管理等4个专业硕士学位授权点，25个本科专业。
历任领导
| 姓名 | 职位 | 任职时间 | 姓名 | 职位 | 任职时间 |
|---|
| 李奕 | 校长 | 1950 | 程鹰 | 校长 | 1980.3-1983.4 |
| 孔繁清 | 校长 | 1952 | 刘凤池 | 党委书记 | 1982.4-1991.3 |
| 李昊誉 | 校长 | 1953-1956 | 李笑云 | 院长 | 1983.11-1996.12 |
| 尹寿民 | 校长 | 1956.1-1957.12 | 郑宗秀 | 党委书记、院长 | 1991.3-1998.11 |
| 魏文超 | 校长 | 1957.12-1973.10 | 马建中 | 党委书记、院长 | 1998.11-2003.2 |
| 杜葆林 | 党委书记、校长 | 1966.2-1979.9 | 李荣堂 | 院长 | 2002.7-2006.5 |
| 徐国通 | 党委书记 | 1979.9-1982.4 | 周铁项 | 党委书记 | 2003.8-2011.12 |
