1941年3月16日，经江西省政府决议，创立江西省立赣县高级助产职业学校。4月筹办，7月招生，8月1日正式开学。1944年12月，日军占领赣州前夕，学校被迫宁都县云田乡布头村，租用民房办学。1945年抗战胜利后，学校迁回赣州，并保留了宁都分校继续办学。并与当年在上饶建立分校。1946年，因省教育厅政策，宁都、上饶分校开始独立办学。1947年9月，江西省立赣县高级助产职业学校更名为江西省立赣县高级医事职业学校。
1949年学校更名为江西省赣州护士助产学校。1951年赣州市立医院附设护士学校并入学校，同年，江西省第四医士学校和江西省第七医士学校创建。1953年江西省赣州护士助产学校、江西省第四医士学校合并组建江西省赣州卫生学校，吉安第七医士学校撤销，学生并入学校。
1958年江西省赣州卫生学校升格为赣南医学专科学校。1959年赣南医学专科学校升格为赣南医学院。1962年赣南医学院改建赣南医学专科学校，赣东大学(医科学生)、井冈山大学(医科学生)、景德镇医学专科学校(学生)并入赣南医学专科学校，同年，赣州专署指定赣州专区人民医院、赣州专区妇幼保健院、赣州市里第一医院为学校教学医院。1963年学校成立科委会。
1968年12月，赣南医学专科学校改建赣州地区六·二六卫生人员学习班。1969年11月，更名为赣州地区六二六卫生学校。1972年1月，赣州地区六二六卫生学校更名为赣南卫生学校，1974年6月，赣南卫生学校恢复大专体制，升格为赣南医学专科学校。
1982年4月，学校开始准备升格为五年制本科学校。1983年，学校首创"生理卫生师资兼校医"专业，后定名为"学校医学"专业，1985年开办"妇女保健"专业，后更名为"妇幼卫生"专业。1984年4月和6月江西省人民政府办公厅分别发布通知，将赣州市第一医院和赣州专区妇幼保健院分别列为学校的第二、第三附属医院。
1988年4月，赣南医学专科学校升格为赣南医学院，同月，杨成武将军提写校名，9月27日，学校举行赣南医学院成立大会暨开学典礼。1993年6月，学校被列为学士学位授予单位。1997年，国家教委公布学校为本科教学评估合格学校。2005年赣州铁路医院并入赣南医学院。[2]
2013年学校获批为硕士学位授予权单位。
2014年开始招收硕士研究生。
| 姓名 | 学校名称 | 职务 | 起讫年月 |
|---|
熊慬(女) | 江西省立赣县高级助产职业学校 | 校长 | 1941.4-1946.3 |
| 熊云珍(女) | 江西省立赣县高级助产职业学校 | 校长 | 1946.4-1947.8 |
熊云珍(女) | 江西省立赣县高级医事职业学校 | 校长 | 1947.9-1949.7 |
钟华、李凤桐、王志健 | 江西省赣州护士助产学校 | 校长 | 1949.10-1951.3 |
李凤桐 | 江西省赣州护士助产学校 | 校长 | 1951.4-1953.3 |
刘德洪 | 江西省第四医士学校 | 校长 | 1951.5-1953.3 |
张德华 | 江西省赣州卫生学校 | 校长 | 1953.4-1954.8 |
蔡德润 | 江西省赣州卫生学校 | 校长 | 1954.8-1958.6 |
| 周晚辉 | 江西省赣州卫生学校 | 党支部书记兼校长 | 1954.8-1958.7 |
乐峰(女) | 赣南医学专科学校 | 党委书记兼校长 | 1958.6-1959.5 |
于清友 | 赣南医学专科学校 | 党委副书记 | 1958.8-1959.5 |
林仁通 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1958.6-1959.5 |
蔡德润 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1958.6-1959.5 |
陈凤九 | 赣南医学院 | 院长 | 1959.5-1962.8 |
于清友 | 赣南医学院 | 党委副书记 | 1959.5-1960.4 |
林仁通 | 赣南医学院 | 副院长 | 1959.5-1962.8 |
蔡德润 | 赣南医学院 | 副院长 | 1959.5-1962.8 |
吴洞昌 | 赣南医学院 | 党委副书记 | 1960.5-1962.8 |
吴洞昌 | 赣南医学专科学校 | 党委副书记 | 1962.8-1966.12 |
陈凤九 | 赣南医学专科学校 | 校长 | 1962.9-1966.12 |
杨文义 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1962.9-1966.12 |
林仁通 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1962.9-1966.12 |
张元晖 | 赣南医学专科学校 | 党委书记 | 1963.8-1966.12 |
杨文义 | 赣南医学专科学校 | 革委会主任 | 1968.3-1968.12 |
朱毓万 | 赣南医学专科学校 | 军代表 | 1968.3-1968.12 |
高惠亭 | 赣州地区六二六卫生人员学习班 | 革委会主任 | 1969.1-1969.12 |
高惠亭 | 赣州地区六二六卫生学校 | 革委会主任 | 1969.12-1972.1 |
高惠亭 | 赣州地区六二六卫生学校 | 党总支书记、党委书记 革委会主任 | 1969.1-1972.1 |
赣南卫生学校 | 1972.1-1973.4 |
高惠亭 | 赣南卫生学校 | 党委书记 | 1972.1-1974.5 |
谭亮(女) | 赣南卫生学校 | 党委副书记 | 1972.1-1974.5 |
谭亮(女) | 赣南卫生学校 | 革委会副主任 | 1973.4-1974.6 |
谭亮(女) | 赣南医学专科学校 | 党核心小组副组长 | 1974.6-1978.11 |
常修 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1978.2-1984.8 |
容敬校 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1978.2-1983.12 |
谭亮(女) | 赣南医学专科学校 | 党委副书记 | 1978.12-1981.12 |
郑熹 | 赣南医学专科学校 | 党委书记 | 1979.4-1984.12 |
林仁通 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1981.3-1983.12 |
吴云生 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1982.4-1984.1 |
吴宣成 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1982.12-1984.1 |
钟垓 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1983.12-1987.7 |
陈方荣 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1983.12-1988.9 |
吴云生 | 赣南医学专科学校 | 党委书记 | 1984.1-1986.5 |
余承棕 | 赣南医学专科学校 | 党委副书记 | 1984.1-1985.6 |
吴宣成 | 赣南医学专科学校 | 校长 | 1984.1-1988.9 |
王宏志 | 赣南医学专科学校 | 党委副书记 | 1985.6-1986.11 |
刘文通 | 赣南医学专科学校 | 党委副书记 | 1985.6-1988.12 |
余德润 | 赣南医学专科学校 | 党委书记 | 1986.5-1988.9 |
王宏志 | 赣南医学专科学校 | 副校长 | 1986.12-1988.9 |
余德润 | 赣南医学院 | 党委书记 | 1988.9-1993.2 |
刘有志 | 赣南医学院 | 党委副书记 | 1988.9-1995.4 |
陈方荣 | 赣南医学院 | 副院长 | 1988.9-1995.6 |
王宏志 | 赣南医学院 | 副院长 | 1988.9-2004.6 |
何侠宝 | 赣南医学院 | 副院长 | 1992.7-1998.4 |
何明 | 赣南医学院 | 纪委书记 | 1992.7-1995.6 |
罗忠民 | 赣南医学院 | 党委副书记 | 1993.6-2004.4 |
吴述仁 | 赣南医学院 | 党委副书记 | 1995.6-2000.3 |
曾浩 | 赣南医学院 | 纪委书记 | 1995.6-2009.8 |
陈方荣 | 赣南医学院 | 院长 | 1995.6-1999.11 |
黄林邦 | 赣南医学院 | 党委委员、院长助理 | 1998.7-1999.12 |
曾浩 | 赣南医学院 | 党委副书记 | 1999.11-2009.8 |
黄林邦 | 赣南医学院 | 副院长 | 1999.12-2001.8 |
沈建华 | 赣南医学院 | 党委副书记、院长 | 2000.1-2001.8 |
沈建华 | 赣南医学院 | 党委书记 | 2001.8-2004.8 |
黄林邦 | 赣南医学院 | 党委副书记、院长 | 2001.8-2012.7 |
曾祥运 | 赣南医学院 | 副院长 | 2001.8-至今 |
韩立民 | 赣南医学院 | 副院长 | 2005.7-2010.12 |
李红勇 | 赣南医学院 | 党委书记 | 2007.3-2011.12 |
刘潜 | 赣南医学院 | 副院长 | 2009.1-至今 |
王柏群 | 赣南医学院 | 副院长 | 2010.11-至今 |
刘民 | 赣南医学院 | 副院长 | 2010.12-至今 |
张裕生 | 赣南医学院 | 纪委书记 | 2011.2-至今 |
陈亮 | 赣南医学院 | 副院长 | 2012.3-至今 |
黄林邦 | 赣南医学院 | 党委书记 | 2012.7-至今 |
| 韩立民 | 赣南医学院 | 党委副书记、院长 | 2012.7-至今 |
特色专业
临床医学
临床医学专业是赣南医学院的王牌专业，目前专业发展情况很好，分流方向比较多，报考的时候应该多留心，有中西医结合临床方向、医事法学方向、医学心理学方向等。主干学科有基础医学和临床医学。临床医学专业的就业面比较广，方向比较多，有兴趣的话可以进一步深造。
麻醉学
麻醉学专业也是五年制的本科专业，目前的就业前景很好，属于医疗部门比较缺的人才，学校对于这个专业的发展也是比较重视的。学生主要学习基础医学，临床医学，麻醉学的理论知识及麻醉学的基本技术，毕业后，可在各级医院从事临床麻醉、重症监测、医疗急救复苏、疼痛诊疗工作。
