1946年，中国共产党以著名教育家陶行知先生命名的行知师范学校（哈师大前身）创立，校址位于南岗区果戈里大街。
1949年，校址整体迁往建国街2号。
1951年，学校分立为松江省省属的松江师专和哈尔滨市市属的哈尔滨师专。1952年，两校又重新合并为松江师专。
1953年，更名为哈尔滨师范专科学校，归教育部所属。
1956年，更名为哈尔滨师范学院，校址位于和兴路50号。
1960年，哈尔滨艺术学院，归入哈尔滨师范学院成立艺术系。
1980年，更名为哈尔滨师范大学。
2000年，呼兰师范专科学校、黑龙江农垦师范专科学校、黑龙江物资职工大学相继并入哈师大。
2001年，学校主体迁到哈尔滨利民经济开发区师大路一号。
2010年，将艺术三大系归于哈尔滨师范大学（江南学区），分别为音乐学院、美术学院、传媒学院。
2010年，阿城校区（阿城学院）搬入江南校区，取消阿城学院。
2014年，呼兰校区（基础教育学院）搬回主校区——哈尔滨师范大学松北校区。
2017年11月，学校获评第一届全国文明校园荣誉称号。
院系专业
截至2018年6月，学校设有25个学院（部），83个本科专业，建有一批省级重点一级学科（群）和省级领军人才梯队。学校具有完备的学士、硕士、博士学位授予体系，有博士学位授权一级学科9个，硕士学位授权一级学科22个，专业硕士学位授权类别8个，博士后科研流动站6个，是全国教育硕士专业学位研究生联合培养示范基地。材料科学学科进入ESI全球排名前1%。马克思主义理论、教育学、美术学和中国语言文学4个一级学科进入全国前30%。
哈尔滨师范大学院系设置| 研究生学院 | 文学院 |
历史文化学院 | 法学院 |
| 政治与行政学院 | 教育科学学院 |
经济学院 | 管理学院
|
| 马克思主义学院 | 西语学院 |
| 东语学院 | 斯拉夫语学院 |
| 公共英语教研部 | 国际教育学院 |
| 数学科学学院 | 计算机科学与信息工程学院 |
| 物理与电子工程学院 | 化学化工学院 |
| 生命科学与技术学院 | 地理科学学院 |
| 音乐学院 | 美术学院 |
传媒学院
| 体育科学学院 |
| 教师教育学院 | 继续教育学院 |
| 艺术学校 | 附属中学 |
哈尔滨师范大学历任校长
李松涛：1980．2至1983.6任哈尔滨师范大学校长；徐国林：1983．6至1997.3任哈尔滨师范大学校长；王佐书：1997．3至1999.12任哈尔滨师范大学校长；陈述涛：1999. 7至2008. 1任哈尔滨师范大学校长；王选章：2008. 1至现今任哈尔滨师范大学校长。
