1965年，贵阳中医学院成立，由原贵阳医学院祖国医学系，贵州省中医研究所，贵州省卫生干部进修学校，贵阳市中医医院合并组建而成，是贵州省唯一的中医药本科院校；
1981年，经国务院学位委员会审定，批准为首批硕士学位授权单位；
2001年，贵州省中医研究院（原研究所合并后成立）、贵州省中药研究所合并组成贵州省中医研究院后整体并入贵阳中医学院；
2002年经教育部、中国石油化工总公司和贵州省人民政府批准，将滇黔桂石油技工学校整体划归贵阳中医学院；
2006年，学校成为省级重点支持建设高校；
2008年，学校被教育部评为本科教学工作水平评估优秀院校。
2016年，贵州省人民政府与国家中医药管理局共建贵阳中医学院。
2019年，教育部正式致函贵州省人民政府，同意贵阳中医学院更名为贵州中医药大学。
院系设置
根据2018年1月学校官网显示，该校有13个教学单位，开办21个本科专业。
| 二级学院 |
| 教学单位 | 专业设置 |
| 基础医学院 | 大学预科教育 |
| 药学院 | 制药工程、药学、药物制剂、中药学、中药制药、中草药栽培与鉴定、生物制药、中药资源与开发 |
| 信息工程学院 | 医学信息工程 |
| 针灸骨伤学院 | 针灸推拿学、康复治疗学 |
| 护理学院 | 护理学 |
| 人文与管理学院 | 法学、应用心理学、劳动与社会保障、公共事业管理、健康服务与管理 |
| 研究生学院 | -- |
| 继续教育学院 | -- |
| 附属医院 |
| 第一临床医学院（贵州省中医医院） | 第二临床医学院（贵阳中医二附院、贵州省中西医结合医院） | |
