1957年10月14日，内蒙古大学举行隆重的建校典礼。时任国务院副总理、内蒙古自治区党委书记、自治区主席的乌兰夫兼任首任校长。中国科学院学部委员、北京大学教授李继侗来校执教并任副校长。
1978年02月，被教育部确定为全国重点大学。
1980年09月，学校党委召开扩大会议，研究制定学校长远发展规划，提出把学校建设成为具有鲜明民族特点和地区特点的全国重点综合性大学。
1984年03月，生物系留日教师旭日干同日本学者合作，成功培育出世界上第一胎体外受精的试管山羊。
1989年03月，在旭日干博士的主持下，内蒙古大学实验动物研究中心成功培育出该国第一胎试管绵羊。同年8月，成功培育出第一胎试管牛。
1992年，蒙古语族语言文学被列为国家高校重点学科。 1993年，与中国农业科学院草原研究所共建农业部重点实验室—草地资源生态重点开放实验室。
1994年01月，在内蒙古大学成立国家教育委员会民族学科蒙古学信息中心。
1994年11月，蒙古语言文学国家文科基础学科人才培养和科学研究基地获教育部批准建设。
1995年，生物学和数理学（试办）2个国家理科基础研究和人才培养基地获教育部批准建设。
1995年05月，旭日干教授当选为中国工程院院士。
1997年，经批准，建立草地资源生态自治区重点实验室、家畜繁殖生物技术自治区重点实验室。
1997年，“中国北方草地草畜平衡动态监测系统试点试验研究”获得国家科技进步二等奖。
1997年09月07日，隆重举行建校40周年庆典，江泽民、李鹏、乔石、李瑞环、李岚清、布赫等党和国家领导人为内蒙古大学题词。
1997年10月，中共中央政治局常委、国务院副总理李岚清到校视察。
1999年，“基因序列的信息学研究”获得国家自然科学三等奖。
1999年，建立自治区高等学校稀土材料重点实验室。
1999年01月，中共中央总书记、国家主席江泽民亲临学校视察。
1999年01月，由内蒙古大学牵头，联合内蒙古工业大学、内蒙古农业大学共建的内蒙古地区国家大学生文化素质教育基地获教育部批准建设，并于2003年通过验收，正式挂牌。这是该地区唯一的国家大学生文化素质教育基地（全国32个）。
2000年，“牛体外受精技术的研究与开发”获得国家科技进步二等奖。
2000年03月，自治区政府决定呼和浩特交通学校并入内蒙古大学，组建内蒙古大学职业技术学院。
2000年08月，哺乳动物生殖生物学及生物技术实验室成为教育部重点实验室。
2000年12月，艺术学院与内蒙古大学正式理顺关系，实现了实质性合并。
2000年12月，蒙古学研究中心被教育部批准为普通高等学校人文社会科学研究重点基地。
2001年，因在国家“863”计划项目中取得显著成就，旭日干院士被国家科技部评为“有突出贡献的先进个人”。
2002年，国家生命科学与技术人才培养基地获教育部批准建设。
2002年01月，中国少数民族语言文学、动物学两个学科被列为全国高等学校重点学科。
2002年10月30日，《内蒙古大学“十五”“211工程”建设项目可行性研究报告》通过内蒙古自治区和国家教育部联合组织的专家组论证。
2003年，与科技部共建内蒙古草地生态学重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地。
2003年05月，中共中央政治局常委、全国人大常委会委员长吴邦国亲临学校视察。
2003年12月，中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林亲临学校视察。
2003年12月，该校曹之江教授主持的“数学分析”课被评为2003年度国家精品课程，曹之江教授被教育部评为首届全国名师。
2004年05月，教育部部长周济和自治区主席杨晶签署协议，成为省（区）部共建学校。[2] 
2006年08月19日，内蒙古大学隆重举行了新（南）校区奠基仪式。
2007年09月07日，内蒙古大学迎来自己的50华诞。[3] 
2010年09月01日，内蒙古大学研究生院成立。[4] 
2015年，艺术学院、鄂尔多斯学院脱离内蒙古大学独立。     2010年全年共获批科研项目423项，共获准科研经费36589万元，到位经费12500万元。发表论文1017篇，被SCI、EI、ISTP、CSSCI检索论文283篇；出版著作90部。
2012年全年共获批科研项目385项，共获准科研经费13182万元，
国家动物转基因技术研究中心到账经费10288万元。被SCI、EI、CPCI-S、CSSCI、SSCI检索论文522篇；出版著作70部。在蒙古学与内蒙古少数民族发展、草地生态学与农牧业生物技术、内蒙古资源利用与环境保护等领域取得重要进展。成功培育出世界首例能产生ω-3脂肪酸的转基因克隆牛和一批优质品种肉牛、转基因克隆绒山羊、体细胞克隆绒山羊；在国内率先开展绵羊精原干细胞移植研究，成功繁育了供体公绵羊的后代；完成了国家动物转基因技术研究中心建设项目；马铃薯产业发展中关键技术研究取得重要成果。面向自治区经济社会发展需求，与政府部门和地方企事业单位开展了大量合作研究，多项成果被采用。
学术资源
截至2012年，图书馆及各分馆、院（所）资料室共入藏纸本文献274万册（其中校本部图书馆223万册），电子图书26万种（其中校本部图书馆21万种），引进中外文数据库42个（其中校本部图书馆41个），自建数据库12个，已建成了具有鲜明民族特点和地区特色，以蒙古学和生命科学为重点，以学校教学、科研专业用书为保障的科学藏书体系。内蒙古大学图书馆已经成为自治区规模最大、文献资源最丰富、现代化服务水平最高、最受读者青睐和欢迎的大型文献信息中心之一。[28] 
学术刊物
内蒙古大学主办有《内蒙古大学学报》（自然科学版）、《内蒙古大学学报》（哲学社会科学版）、《内蒙古大学学报》（蒙古文社会科学版）等自治区级学术刊物，是中国核心期刊之一。