第六军医大学
1946年，创建松江军区医学院；
1947年，创建合江地区卫生学校；
1949年，松江军区医学院、合江地区卫生学校合并，组建中国人民解放军东北军区卫生学校；
1949年，更名中国人民解放军第四野战军医科学校；
1949年，南昌医学院（可追溯至中正医学院）、第四野战军医科学校合并，组建中国人民解放军华中医学院。
1950年，更名中国人民解放军中南军区医学院；
1951年，更名中国人民解放军第四军医学院；
1952年，更名中国人民解放军第六军医大学。
第七军医大学
1941年，建立太岳军区卫生部卫生教导队；
1944年，更名太岳军区卫生部看护训练班；
1946年，更名晋冀鲁豫军区太岳卫生学校；
1948年，更名中原军区四纵队卫生学校；
1948年，中原军区四纵队卫生学校、国立河南大学（医学院中留开封部分）合并组建中原大学（医学院）；
1949年，中原大学（医学院）分出，改建中国人民解放军第二野战军医科大学；
1950年，更名中国人民解放军西南军区卫生部医科大学；
1951年，更名中国人民解放军西南军区医学院；
1951年，更名中国人民解放军第二军医学院；
1952年，更名中国人民解放军第七军医大学。
合并至今
1954年，第六军医大学并入第七军医大学。
1965年，野战外科研究所并入。
1969年，迁往上海，1975年迁回重庆。
1975年，第七军医大学更名中国人民解放军第三军医大学。
1981年，经国务院批准，学校成为全国首批博士和硕士学位授予单位。
1999年，解放军成都医学高等专科学校并入，成为第三军医大学成都军医学院。
2004年，第三军医大学（成都军医学院，原解放军成都医学高等专科学校部分）分出，移交地方建立成都医学院。
2017年6月10日0时，第三军医大学划归陆军建制领导管理。中国人民解放军第三军医大学学校更名为中国人民解放军陆军军医大学。
2019年5月，陆军军医大学与西南大学签署军民融合医学发展合作协议。
2020年1月24日晚，医疗队在重庆江北国际机场停机坪集结。 除夕夜，由陆军军医大学抽调精干医务人员，组建的150人医疗队连夜从重庆出发，飞赴武汉支援抗击新型冠状病毒感染的肺炎疫情。
院系专业
截至2014年，学校下设基础部、公共卫生与军事预防医学院、药学院、生物医学工程学院、医学心理系、高原军事医学系、医学检验系、医学影像系、护理系9个院系部和研究生管理大队、干部轮训大队、卫勤训练大队3个大队，1个学员旅、以及西南医院、新桥医院、大坪医院野战外科研究所三所综合性教学医院。共开设基础医学、临床医学、预防医学、药学、医学检验技术等5个本科专业。
| 序号 | 专业大类 | 专业小类 | 具体专业 |
| 1 | 医学 | 基础医学类 | 基础医学 |
| 2 | 临床医学类 | 临床医学 |
| 3 | 公共卫生与预防医学类 | 预防医学 |
| 4 | 药学类 | 药学 |
| 5 | 医学技术类 | 医学检验技术 |
师资力量
截止2014年，学校拥有高级专业技术职务人员850余名，其中两院院士4名，国务院学科评议组成员4名，“长江学者”特聘教授7名，国家“973计划”项目首席科学家7名，国家杰出（优秀）青年科学基金，博士生导师277名、硕士生导师376名，教育部和重庆市高校创新团队8个。
中国工程院院士（专职2名）：王正国、程天民
中国科学院院士（专职2名）：孔祥复 、卞修武
教育部高校创新团队（4个）：严重创伤细胞保护机制和干预研究（黄跃生），蛋白质抗原的识别、应答及其调节（吴玉章），代谢性血管病发病机制及其干预靶点的研究（祝之明），严重创伤致肠稳态失衡机制及干预策略研究（杨桦）
教学建设
截止2014年，学校有国家级实验教学示范中心1个、国家级虚拟仿真实验教学中心1个、国家精品课程2门、军队院校优质课程3门，国家级重点领域创新人才团队1个，重庆市级教学团队3个。
特色专业：临床医学、医学检验、病理检验、预防医学、法医学、高原军事医学
国家级实验教学示范中心（1个）：军事作业环境损伤与医学防护实验教学中心
国家级虚拟仿真实验教学中心（1个）：军事作业医学虚拟仿真实验教学中心
国家精品课程（2门）：核、化学武器损伤防治学（程天民）、内科学及野战内科学（钱桂生）
军队院校优质课程（3门）：外科学与野战外科学（王正国）、内科学及野战内科学（钱桂生）、核、化学武器损伤防治学（程天民）
国家级重点领域创新人才团队（1个）：免疫识别、应答及调控研究创新团队（吴玉章）
重庆市级教学团队（3个）：内科学教学团队（钱桂生）、人体解剖与组织胚胎学教学团队（应大君）、外科学教学团队（麻晓林）
“十五”期间，全校获得国家教学成果二等奖2项，军队教学成果一等奖3项，获电教教材奖48项，其中获国家一等奖2项，二、三等奖7项，课题立项数与成果获奖数均比“九五”翻了两番。
国家级教学成果奖一等奖：创建现代军事医学学科体系，培养新型军事医学人才的研究与实践（程天民等）
国家级教学成果奖二等奖：医学基础类学科群课程体系的构建与实践研究（黎海蒂）、军事预防医学”新学科的创建与教学实践（程天民）
先后主编并入选“全国研究生教学用书”6部，入选全国百篇优秀博士学位论文7篇，入选全军优秀博士学位论文10篇、优秀硕士学位论文15篇，重庆市优秀博士学位论文31篇。
在校学员积极参加科研活动，每年公开发表论文上百篇；参加国家和军队各类竞赛活动获奖144项，其中国家特等奖13项、一等奖38项，参加“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛接连捧得优胜杯，参加全国大学生英语竞赛连续三年居重庆高校首位；国家计算机等级（二级）考试一次性通过率达90%以上，参加国家英语四级首次通过率始终保持在80%以上，均高于全国重点院校平均水平。
证书编号规律：
毕（结）业証书编号即为注册号，使用阿拉伯数字，统 一规范为18位。
（一）普通、成人高等教育毕（结）业証书注册号由学 校或其他教育机构按以下顺序编排：前5位为学校或其他 教育机构的国标代码；第6位为办学类型代码；第7至10 位为年份；第11至12位为培养层次代码；第13位至17位 为学校对毕（结）业証书编排的序号。2002年学历证书 编号扩充至18位(但当年有部分高校仍使用17位)。
（二）高等教育自学考试及高等教育学历文凭考试毕业 证书注册号，由各省（自治区、直辖市）高等教育自学 考试委员会按以下顺序编排：第1位为办学类型代码；第 2位为培养层次代码；第3、4位为省（自治区、直辖市） 国标代码；第5、6位为地（市）国标代码；第7、8位为 县（区）国标代码；第9、10位为年度代码；第11位为上 、下半年考试考次代码；第12至16位为准考证序号代码 ；第17位为校验代码。
（三）办学类型代码：普通高等教育1；成人高等教育5 ；高等教育自学考试和高等教育学历文凭考试6；网络教 育为7。
（四）培养层次代码：博士研究生01；硕士研究生02； 第二学士学位04；本科05；专科（含高职）06。
毕业证分类、打印规则、相片要求、签名章：
统招毕业证书：97年以前全是手写的,97年以后，陆续打印。相片从98以后，全部是彩色。成人教育毕业证书：2001以前，全部手写，相片黑白，2001年后，全部打印，相片彩色 。 自考毕业证书:2003以前自考,发证机关,都是省教委发放的样本。2000年左右毕业证的相片大多是红色的背景， 06,07年以后才要求是蓝色背景。校长签名章的种类从外形上区分有二大类,即方章,条章,八十年代九十年代基本上都是方章,二千年左右开始出现条章,现在校长签名章是方章条章并存!校长签名章在使用时候又分红蓝两种颜色,八十年代九十年代基本上都是红色,二千年左右开始出现蓝色,现在蓝色使用多过红色了!
