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2002年8月，新疆大学科学技术学院成立。
2004年1月，通过教育部关于办学资质的审核，成为我国首批本科院校举办的独立学院。
2012年5月，通过新疆维吾尔自治区学位委员会、自治区教育厅审核，学院取得学士学位授予权资格。
2014年5月，阿克苏地区行署与新疆大学签订合作办学协议。2014年6月，自治区人民政府下发《关于合作建设新疆大学科学技术学院事宜的批复》（新政函〔2014〕85号），决定新疆大学与阿克苏地区合作办学，由地区负责完成校园基本建设，校园建成后，将新疆大学科学技术学院搬迁至阿克苏办学，由新疆大学负责教学和管理。条件成熟、申请教育部评估合格后转制为公办本科院校。
2015年3月，新疆大学科学技术学院（阿克苏校区）工程逐步全面开工建设。同年9月，新疆大学科学技术学院（阿克苏校区）一期工程竣工（投资15亿)。同年首批招生四个专业，招生计划695名，报到率高，招生工作圆满完成，体现了新疆精神、阿克苏效率。
2019年5月，拟更名为新疆理工学院