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研究机构
截止到2014年3月，学校拥有1个省级教学重点实验室，市级研究所4所，市级研究中心2个，市级研究院1个。
省级教学重点实验室1个：光电信息技术教学重点实验室。
市级研究所4所：高等教育研究所，音乐研究所，池田大作研究所，果树研究所。
市级研究中心2个：生物医药工程中心，福慧佛学研究中心。
市级研究院1个：西江历史文化研究院。
科研成果
截止到2013年，学校教师在核心期刊共发表文章1768篇，其中，被SCI等收录218篇，出版教材及专著275部，获市厅级以上科研立项342项 。其中，2012年获国家自然科学基金5项，国家社科基金1项。
学术资源
图书馆
截止2013年3月，学校图书馆纸质藏书144.3万册，电子图书2335GB，纸质报刊1500多种，拥有音像、光盘等资料20000多种（件），开通了《中国数字图书馆》、《中国期刊网》、《SpringerLink》等10多个全文数据库。
学术期刊
《肇庆学院学报》1998年9月，经广东省新闻出版局审核，并报国家新闻出版署批准，正式转为公开发行的学术期刊，中国期刊全文数据库（CJFD）全文收录期刊，中国学术期刊综合评价数据库统计源期刊，中国核心期刊（遴选）数据库收录期刊，中国科技期刊数据库（全文版）收录期刊，《CAJ-CD规范》执行优秀期刊，第二届全国地方高校优秀学报。