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1945年2月，在战区第一劳动农场基础上筹建“国立高级农业职业学校”（简称“国立高农”) ，隶属国民党中央教育部，校部设于重庆市江北杨家花园。

1945年10月，开始招生办学。

1946年8月，东迁南通，租用南通市南门外松树路朱公馆及惠潮会馆 一百余间房舍作临时校舍。

1947年元旦，学校更名为“国立南通高级农业职业学校”。不久，迁往三里墩张氏义圆 （ 现南通大学钟秀校区 ) 办学。

1949年1月，迁往上海沪西金司徒庙和高桥；同年7月，回南通市三里墩校址复课。

1949年10月，学校改称“苏北南通农业学校”。

1951年7月，迁往南通狼山脚下办学。

1953年10月，学校改名为“江苏省南通农业学校”。

1958年7月，学校增挂南通农业专科学校校牌，并在如皋薛窑地区增设南通农业学校永平分校。

1959年，南通农校和南通农业专科学校迁往如皋薛窑与永平分校合一。

1962年10月，学校改为南通专区农业干校。

1965年，复办江苏省南通农业学校。

1975年4月，经江苏省革委会批准成立“南通地区五七农业大学”，实行南通地区五七农业大学、农科所、农机站、粮棉原种场、种猪场五位一体的领导机制。

1979年4月，学校正式恢复“江苏省南通农业学校”。

1990年8月，学校自如皋薛窑迁至南通市青年东路。

1992年，学校通过国家农业部合格评估。

1998年，顺利进入省部级重点中专行列。

2000年，成为首批国家级重点中专。

2003年7月，学校升格为“南通农业职业技术学院”。

2014年10月，经江苏省人民政府批准学校更名为南通科技职业学院。

2015年11月27日，正式挂牌更名为南通科技职业学院。 

办学条件

 

院系专业

截至2015年12月，南通科技职业学院共建有生物工程系、园林园艺系、环境与资源系、机电工程系、经济贸易与管理系、人文科学系、信息工程系、继续教育学院、天樱国际教育学院、基础教学部等教学机构，开设高职专科专业52个。 

教学系	专业名称
环境与资源系	环境监测与治理技术、环境工程技术、城市水净化技术、环境监测与评价、工业环保与安全技术、工业分析与检验、应用化工技术
生物工程系	植物保护、生物技术及应用、水产养殖技术、农产品质量检测、食品加工技术、食品营养与检测
园林园艺系	园林技术、城市园林、园林工程技术、园艺技术、环境艺术设计、都市园艺
机电工程系	机械制造与自动化、数控技术、应用电子技术、电梯工程技术、机电一体化技术、电气自动化技术
经济贸易与管理系	会计与统计核算、营销与策划、电子商务、物流管理、工程造价、农业经济管理
信息工程系	软件外包服务、广告与会展、计算机网络技术、软件技术、计算机应用技术、网络系统管理、装潢艺术设计、楼宇智能化工程技术
人文科学系	文秘、旅游日语、法律文秘、商务日语、商务英语、航空服务、旅游管理